Lescure, AlainMahboub, Nedaa Yousef2023-11-192023-11-192023-03-31MAHBOUB, Nedaa Yousef; 31/03/2023; Genomic and biochemical characterization of a bacterial homolog of Selenoprotein N, a selenium-containing protein involved in congenital muscular dystrophy [Manuscript submitted for publication]; Molecular and Cellular Biology Institute; University of Strasbourghttps://hdl.handle.net/20.500.14154/69714السيلينون هوعبارة عن بروتين غشائي يوجد في الشبكة الإندوبلازمية داخل الخلية الحيوانية. تم ربط الطفرات في الجين المنتج لبروتين السيلينون بأ مراض عضلية وراثية مختلفة تظهر في الجنس البشري في الغالب، وقد ثبت أن بروتين السيلينون يدخل في نمو العضلات وتجديدها وفي غير ذلك من العمليات الحيوية في الخلية كدوره في حماية الخلية من الأكسدة التفاعلية الضارة وتنظيم مستوى الجلكوز في الدم وإنتاج الطاقة من المايتوكوندريا. ومع ذلك ، فإن الوظيفة التحفيزية للسيلينون مُبهمة للآن. في الحقيقة، حد د بحث المعلوماتية الحيوية جين ا متماثلا للسيلينون في مجموعة واحدة من البكتيريا الغير مصنفة ، الكانديداتوس بوريباكتيريا. هذه البكتيريا تعيش مع الإسفنج البحري في عيشة تكافلية، ولا يمكن زراعتها خارج موطنها الأصلي بعد. ر ك ز مشروع الأطروحة على دراسة التحليل الجيني لسلالات مختلفة م ن البوريباكتيريا. لقد قمتُ خلال رسالتي باستخراج نوع واحد من بروتين السيلينون والجين المرتبط معه، ثم قمت بالتعبير عن بروتين السيلينون وتنقيته لاستخدامه في تجارب تحيليلة لإيجاد وظيفة السلينون في المستقبل. في الجزء الثاني من المشروع، قمتُ بدراسة وفرة وتوزيع البوريباكتيريا في هياكل الإسفنج المضيف، الأبليزينا إيروفوبا باستخدام تقنية التهجين الفلوري، والفحص المجهري الإلكتروني. أتاحت لنا هذه الدراسات بالحصول على معلومات حول تفاعل البكتيريا مع الجسم المُضيف والمساهمة المحتملة لبروتين السيلينون في البيئة التعايشية مع الإسفنج البحري .Selenoprotein N (SelenoN) is an endoplasmic reticulum resident transmembrane protein. Mutations in the SELENON gene were linked to different inherited forms of muscular diseases in Humans and the SelenoN protein was shown to be implicated in muscle development and regeneration. However, the catalytic function of SelenoN remains elusive. Bioinformatics search identified a gene homologous to SELENON in one single group of unclassified bacteria, Candidatus Poribacteria. This bacterium is a marine sponge symbiont, yet-to-be cultured. The thesis project has focused on the study of this bacterial ortholog of SELENON. Genomic analysis of different Poribacteria strains identified multicopy of SELENON gene, organized in tandem repeat or in operon with other genes. During my thesis I amplified one form of the SELENON gene and its operon-associated gene, and then expressed and purified the SelenoN protein to be used for functional analyses in the future. In the second part of the project, I studied the abundance and distribution of Poribacteria in the structures of the host sponge, Aplysina aerophoba, using fluorescence in situ hybridization technique, transmission electron microscopy, and immuno-gold labeling. These studies allowed us to get information about the sponge-bacteria interaction and the possible contribution of SelenoN to the symbiosis.265enSelenoprotein NCandidatus Poribacteriamarine spongesymbiotic interactionThesis