Application of Immunomagnetic beads and PCR methods for detection of pathogenic Vibrio parahaemolyticus in coastal water in Eastern Province of Saudi Arabia

Thumbnail Image

Date

2020

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Imam Abdulrahman Bin Faisal University

Abstract

Von Willebrand disease (VWD) has been identified as the commonest inherited bleeding disorder in humans. The prevalence of this disease is as high as 1% in the general population. The objective of this study is to identify if any mutation that is unique to the Saudi population, which could be used to establish a diagnostic method for type 1 VWD in Saudi Arabia and help in management. In this study 22 index cases (IC) who were previously diagnosed with type 1 VWD were recruited, as well as 21 affected family members (AFM) and 17 unaffected family members (NAFM). All samples were collected from King Fahad Hospital of the University Al Khobar. For all participants, a bleeding score was recorded. ABO blood group and VWD basic and special screening tests were done. Mutation analysis was performed for all samples for the exons that have been most frequently reported, which are exons 18, 20, 26, 28 and 52. The phenotypic analysis showed that the bleeding score is significantly higher in the IC compared to the other groups, and the most common bleeding symptoms are menorrhagia, cutaneous bleeding and gum bleeding. VWF Ag level, Ristocetin cofactor assay and factor VIII levels were significantly lower in IC and AFM groups compared to NAFM and control groups. The mutational analysis showed 39 different variants, 25 of them are exonic and 14 intronic. 15 of the exonic variants are missense variants, while there were 7 synonymous variants identified. Most of the variants are normal benign variants. Two pathogenic variants were identified in exon 28 which are (c.3797C>A) and (c.3797C>T). To conclude, this study is a baseline for other studies to be conducted in Saudi Arabia with a larger number of participants, more exons to be analyzed and more cities to be included to give a better understanding of this disease.

Description

يعتبر مرض فون ويليبراند من أكثر أمراض النزيف الوراثية شيوعا في الجنس البشري. نسبة الإصابة بهذا المرضمرتفعة وتصل إلى 1 % من أفراد المجتمع. هدف الدراسة هو معرفة الاعتلالات الجينية الموجودة في المنطقة الشرقيةمن المملكة العربية السعودية والمحاولة لإيجاد طريقة تسهل تشخيص المرض وعلاجه. من خلال هذا البحث تم عملتحليل للنمط الظاهري والنمط الجيني ل ) 22 ( شخصا تم تشخيصهم مسبقا بالإصابة بمرض فون ويليبراند من النوعالأول في مستشفى الملك فهد الجامعي بالمنطقة الشرقية من المملكة العربية السعودية. وتم عمل نفس التحاليل ل ) 21 )مصاب من أقارب المريض و ) 17 ( غير مصاب من أقارب المريض. تم قياس درجة النزيف عند جميع المشاركينوعمل تحليل فصيلة الدم وتحليل النمط الظاهري للبروتين لجميع المرضى. كما تم عمل التحليل الجيني لخمسة مناطقجينية ) exon ( تعتبر من أكثر المناطق التي تحتوي على اعتلالات عند المرضى المصابين ب فون ويليبراند وهيكالتالي 18 و 20 و 26 و 28 و 52 . من خلال الدراسة تبين أن المصابين بمرض فون ويليبراند لديهم درجة نزيف أعلىمن أقاربهم المصابين وغير المصابين. وأن أكثر الأعراض النزفية شيوعا لدى المصابين هو نزيف الحيض والنزيفتحت الجلدي ونزيف اللثة. أما تحليل النمط الظاهري فقد تبين أن المرضى المصابين بفون ويليبراند والمصابين منأقاربهم لديهم معدلات أقل من بروتين فون ويليبراند ومعامل الريستوسيتين وعامل التجلط الثامن في الدم مقارنةبأقاربهم غير المصابين والأشخاص الطبيعيين. أما التحليل الجيني فقد أظهر وجود 39 طفرة جينية مختلفة. 25 طفرةداخل الإكزون و 14 طفرة في منطقة الإنترون. كما تبين أن 15 طفرة تسبب تغير في الحمض الأميني ) missense )و 7 طفرات لا تسبب تغير في الحمض الأميني ) synonymous (. ومعظم الطفرات التي تم تحديدها هي طفرات شائعةولا تسبب المرض ولكن تم تحديد طفرتين تعتبر مسببة لمرض فون ويليبراند وهما ) c.3797C>A ( و( c.3797C>T (. ختاما تعتبر هذه الدراسة بمثابة حجر الأساس لدراسات مستقبلية بمشاركة عدد أكبر من المصابينوتغطية مناطق جينية أكثر على أن يتم جمع العينات من أكثر من منطقة من مناطق المملكة لتعطي فهما أكبر للمرض

Keywords

parahaemolyticus, human pathology, Flagella, DNA extraction

Citation

Endorsement

Review

Supplemented By

Referenced By

Copyright owned by the Saudi Digital Library (SDL) © 2025