Phenotypic and genotypic characterization of patients diagnosed with Von Willebrand Disease type 1 in the eastern province in Saudi Arabia
Date
2020
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Imam Abdulrahman Bin Faisal University
Abstract
Background: Venous thromboembolism (VTE) is one of the major complications inmost cancer patients leading to poor prognosis and short survival. Several commonclinical risk factors coexist in cancer patients are used as risk predictive biomarkers tohelp in the management and prevention of VTE. These include cancer site and stage,chemotherapy regimen and elevated biological markers. However, Geneticpolymorphisms in genes controlling coagulation and fibrinolysis significantly associatedwith VTE if detected, then they might be more sensitive individual predictive biomarkersfor VTE risk assessment. This study was conducted to evaluate the association betweenITGB3 rs3809865 and rs5918 with VTE risk as well as monitor the effect of VTE onoverall survival of these cancer patients.Method: In this retrospective case-control study, 195 FFPE cancer patients’ sampleswere collected (controls n=157, case n=38) using the stored data through Jan 2010 to Sep2018 from King Fahad Specialist Hospital in Dammam. Samples were genotyped usingTaqMan genotyping assay, then logistic regression analysis and Chi-square were used topredict the association between risk factors and VTE. Survival Comparison was tested bythe log-rank test.Results: Genetic polymorphisms in ITGB3 (rs3809656 and rs5918) found not to beassociated with VTE increasing risk in cancer patients (P>0.05). While the advancedstage was potentially increasing the risk of VTE events (OR 5.1 CI 2.01-12.9 P=0.001).Patients with VTE showed a poor overall survival reflected by the median survival rateof only three years compared to seven years for cancer patients without VTE.Conclusion: This study highlighted the potential influence of VTE on prognosis andsurvival of cancer patients and raised the importance of exploring risk predictivebiomarkers in our population. This will improve the risk prediction biomarkers leadingto implementing safe and effective thrombosis prophylaxis strategies
Description
المقدمة: تعتبر جلطات الأوردة الدمویة من المضاعفات الشائعة التي یعاني منھا معظم مرضى السرطان والتيتؤدي إلى تدھور حالة المریض ومن ثم الوفاة. تتوافر مؤشرات مشتركة بین مرضى السرطان لتوقع خطر الإصابةبالجلطات وتُستخدم لأخذ الاحتیاطات العلاجیة لتجنب حدوثھا. من أھم ھذه المؤشرات: موضع الورم السرطاني ونظامالعلاج الكیمیائي المتبع وغیرھا. تطرأ بعض التغیرات في الجینات المسؤولة عن نظام التخثر في الدم حیث تؤدي إلى(Single Nucleotide Polymorphism -SNP) تغیرات فردیة متعددة الأشكال في النیوكلیوتیداتوالتي ترتبط مع قابلیة حدوث جلطة وریدیة، وبالتالي یمكن استخدامھا كمؤشر لقیاس قابلیة المریض للإصابة.(rs3809865,rs في ھذة الدراسة تم البحث عن العلاقة بین التغیرات الفردیة متعددة الأشكال للنیوكلیوتیدات ( 5918وزیادة خطر الإصابة بالجلطات الوریدیة في مرضى السرطان في المنطقة الشرقیة في المملكة العربیة ITGB في 3السعودیة، بالإضافة إلى مراقبة تأثیر حدوث ھذة الجلطات على المعدل العام للحیاة في ھؤلاء المرضى. ووفق اًللأبحاث المنشورة تعتبر ھذه الدراسة ھي الأولى في المملكة.طریقة البحث: في ھذه الدراسة تم جمع 195 عینة من مرضى السرطان ( 38 عینھ من المصابین بالجلطة و 157من غیر مصابین) من ینایر 2010 إلى سبتمبر 2018 باستخدام قاعدة البیانات في مستشقى الملك فھد التخصصيTaqMan® Genotyping ) بالدمام. تم استخلاص الحمض النووي من العینات ثم التنمیط الجیني باستخدامبعد ذلك تم تحلیل بیانات العلاقة عن طریق مربع كاي والإنحدار اللوجستي، ثم تم دراسة أثر ھذة الجلطات .(Assayعلى حیاة المرضى عن طریق تحلیل لوغاریتم الرتب.وزیادة خطر الإصابة بالجلطات الوریدیة rs3809865 , rs النتائج : أثبت الدراسة أنھ لا یوجد ترابط بین 5918في المقابل , تم إثبات الترابط الوثیق بین خطر . (P> في مرضى السرطان حیث كانت القیمة الإحتمالیة ( 0.05P= الإصابة بالجلطات الوریدیة و مرض السرطان في المراحل المتقدمة حیث كانت القیمة الإحتمالیة للبحث 0.001كما أظھرت الدراسة ضعف فرص البقاء على قید الحیاة بالنسبة لمرضى السرطان . (OR 5.1 CI 2.01 -12.9 )المصابین بالجلطات الوریدیة حیث كان معدل البقاء لمرضى السرطان المصابون بالجلطة الوریدیة ثلاث سنواتفقط مقابل سبع سنوات بالنسبة لمرضى السطان الغیر مصابین بالجلطات.الإستنتاج : سلطت ھذة الدراسة الضوء على التأثیرات المحتملة للجلطات الوریدیة في مرضى السرطان على الحالةالتشخیصیة للمرض وفرص البقاء على قید الحیاة. وبھذا یتضح ضرورة إستكشاف مؤشرات حیویة لقیاس قابلیةالمرضى للإصابة بالجلطات الوریدیة في المملكة العربیة السعودیة، مما سیساعد في تطبیق استراتیجیات آمنة وفعالةللمعالجة الوقائیة من الجلطات في مرضى السرطان.
Keywords
pseudogene, Von Willebrand, Phenotypic, Genotypic, DNA sequencing